173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23850 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 484 aa  976    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  43.31 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  37.89 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.3 
 
 		 485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.12 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 467 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.32 
 
 		 485 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  27.27 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  32.61 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 442 aa  91.3  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  23.58 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 468 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.17 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 420 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.24 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.69 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  21.69 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 442 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  24.39 
 
 		 451 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 467 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.2 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.34 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 614 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.26 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.95 
 
 		 451 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 464 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25.97 
 
 		 417 aa  50.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.07 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  27.34 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 493 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.66 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 544 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.76 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.84 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  24.69 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>