97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6838 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 379 aa  766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 381 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  29.44 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  33.69 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  26.5 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  33.22 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  26.76 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  24.27 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.47 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  27.48 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  25.31 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.11 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  21.8 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  22.25 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  29.89 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.66 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  23.39 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  22.16 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.5 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  24.14 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  29.28 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  21.75 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  24.49 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 		 586 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  25.18 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  23.64 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  35.48 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  23.68 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 188 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  23.68 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 588 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 229 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 219 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  35.37 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 470 aa  46.6  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  21.69 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0440  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 526 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3153  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0421  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0413788  hitchhiker  0.00000000225621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  38.1 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.19 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  25.45 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  44.26 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2258  transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 476 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 213 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 213 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.42 
 
 		 217 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.82 
 
 		 536 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>