120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1244 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  100 
 
 		 749 aa  1550    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  35.29 
 
 		 717 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  34.85 
 
 		 717 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  42.24 
 
 		 717 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  37.91 
 
 		 782 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  35.81 
 
 		 798 aa  294  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  37.02 
 
 		 695 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  28.59 
 
 		 955 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  39.2 
 
 		 760 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  41.01 
 
 		 759 aa  271  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  39.6 
 
 		 765 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  36.55 
 
 		 524 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  37.68 
 
 		 755 aa  266  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  32.11 
 
 		 874 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  32.11 
 
 		 874 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  35.46 
 
 		 467 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  33.72 
 
 		 482 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  34.62 
 
 		 738 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  31.97 
 
 		 843 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  33.63 
 
 		 462 aa  228  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  32.57 
 
 		 882 aa  227  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  36.13 
 
 		 472 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.98 
 
 		 746 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.98 
 
 		 746 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.61 
 
 		 774 aa  224  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  32.12 
 
 		 554 aa  225  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  31.15 
 
 		 842 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  34.57 
 
 		 725 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  30.25 
 
 		 770 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  32.62 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  32.62 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  30 
 
 		 900 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  26.99 
 
 		 723 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  33.72 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  33.97 
 
 		 470 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  32.07 
 
 		 697 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  26.53 
 
 		 624 aa  191  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  30.49 
 
 		 857 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  38.23 
 
 		 612 aa  178  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  38.87 
 
 		 479 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  30.97 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  25.16 
 
 		 788 aa  147  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  29.4 
 
 		 757 aa  140  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  28.9 
 
 		 632 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  26.6 
 
 		 540 aa  127  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  30.73 
 
 		 799 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.23 
 
 		 283 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  23.78 
 
 		 531 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  42.95 
 
 		 283 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  27.49 
 
 		 486 aa  107  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  45.21 
 
 		 289 aa  104  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  31.43 
 
 		 263 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.85 
 
 		 970 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.67 
 
 		 287 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  30.72 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.07 
 
 		 769 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.38 
 
 		 828 aa  100  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 		 970 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  31.55 
 
 		 263 aa  99  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.2 
 
 		 271 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  34.41 
 
 		 266 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  33.33 
 
 		 266 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  27.35 
 
 		 486 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  31.25 
 
 		 391 aa  94  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  38.03 
 
 		 746 aa  88.2  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.88 
 
 		 599 aa  87.8  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.24 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  24.67 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  29.21 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  33.84 
 
 		 255 aa  79.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  26.34 
 
 		 1172 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  26.34 
 
 		 1172 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  20.96 
 
 		 463 aa  72  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  30.57 
 
 		 1061 aa  68.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.37 
 
 		 206 aa  68.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.28 
 
 		 1285 aa  67.8  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.33 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  29.58 
 
 		 295 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  23.94 
 
 		 1145 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  32.62 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  40.19 
 
 		 183 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.82 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  22.95 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.36 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.33 
 
 		 771 aa  61.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.67 
 
 		 201 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  24.67 
 
 		 624 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  34.65 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.67 
 
 		 201 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  30.92 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.72 
 
 		 978 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23.24 
 
 		 501 aa  55.8  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  20.25 
 
 		 542 aa  55.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  24.18 
 
 		 1000 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.06 
 
 		 289 aa  54.3  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0105  hypothetical protein  30.63 
 
 		 382 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  23.68 
 
 		 777 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  32.11 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  23.68 
 
 		 777 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>