More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2672 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  100 
 
 		 513 aa  1050    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  71.22 
 
 		 497 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  70.1 
 
 		 502 aa  712    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  71.43 
 
 		 497 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  68.73 
 
 		 506 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  47.34 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  46.89 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  46.98 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  41.6 
 
 		 595 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  40.56 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  43.22 
 
 		 516 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  42.14 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  37.6 
 
 		 509 aa  339  7e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  37.8 
 
 		 509 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  41.22 
 
 		 510 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  35.31 
 
 		 509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  34.91 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  36.94 
 
 		 509 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  34.12 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  39.92 
 
 		 645 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  38.9 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  36.44 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  36.14 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  36.44 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  34.87 
 
 		 520 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  36.88 
 
 		 530 aa  296  6e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  34.2 
 
 		 503 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  33.6 
 
 		 520 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  37.2 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  33.2 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  37.05 
 
 		 508 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  38.38 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 532 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  34.33 
 
 		 516 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  35.99 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  34.67 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  33.6 
 
 		 518 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  33.47 
 
 		 522 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  33.93 
 
 		 518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  32.17 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  32.38 
 
 		 514 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  33.2 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  32.11 
 
 		 514 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  33.73 
 
 		 503 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  31.62 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  36.43 
 
 		 635 aa  232  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  28.49 
 
 		 938 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  29.17 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  28.09 
 
 		 518 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  30.1 
 
 		 504 aa  143  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  28.09 
 
 		 505 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.97 
 
 		 507 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  29.65 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.4 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  28.52 
 
 		 518 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  28.52 
 
 		 518 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.48 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 717 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  27.78 
 
 		 708 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  25.45 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.68 
 
 		 740 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.68 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.75 
 
 		 511 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.21 
 
 		 493 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.72 
 
 		 512 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.18 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  28.75 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  26.98 
 
 		 499 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.95 
 
 		 511 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.61 
 
 		 511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 547 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  26.77 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  26.61 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.26 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  25.68 
 
 		 546 aa  117  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  23.87 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  27.49 
 
 		 552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  27.89 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 547 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 559 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 510 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.74 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  24.3 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.55 
 
 		 531 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.45 
 
 		 544 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  25.59 
 
 		 711 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  25.54 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.6 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  26.93 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  27.12 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 722 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  26.36 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>