126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1174 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  93.15 
 
 		 219 aa  415  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  81.11 
 
 		 216 aa  361  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  50.48 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  49.52 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  49.52 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  48.56 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  49.04 
 
 		 244 aa  177  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  44.75 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  45.91 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  45.91 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  44.39 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  46.35 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  42.65 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  43.13 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  39.39 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  41.71 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  40.1 
 
 		 206 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  40.1 
 
 		 206 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  36.32 
 
 		 202 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  39.52 
 
 		 196 aa  132  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  38.58 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  39.39 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  39.39 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  39.5 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  39 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  39.5 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  39.18 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  34.21 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  34.21 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  33.77 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.32 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  35.07 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.91 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.91 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.37 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  33.67 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  35.18 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  33.17 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  32.68 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  32.68 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  34.72 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  34.13 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  35.5 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  33.68 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  31.72 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  30.65 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  35.23 
 
 		 195 aa  98.2  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  30.33 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  37.95 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  35.6 
 
 		 190 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  32.98 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  34.48 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  34.97 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  34.57 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  32.85 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  34.43 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  34 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  52.11 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  32.07 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  30.32 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  33.85 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  23.19 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  22.71 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  32.48 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  34.07 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  40.58 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  42.31 
 
 		 87 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  44.12 
 
 		 75 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  32.88 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  32.88 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  45.45 
 
 		 67 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  28.57 
 
 		 641 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  47.27 
 
 		 68 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 80 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  42.86 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  48 
 
 		 72 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 73 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  46.55 
 
 		 68 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  35.14 
 
 		 147 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 74 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  30.38 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 69 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 138 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 69 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  48 
 
 		 79 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>