85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4623 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  338  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  65.1 
 
 		 152 aa  207  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  48.37 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  42.58 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  31.15 
 
 		 195 aa  88.6  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  41.49 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  51.28 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  33.11 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  32.69 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  50.67 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  31.69 
 
 		 295 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  39.33 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  36.3 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  34.84 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  39.44 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  31.25 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  45.33 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  31.17 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  36.65 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  31.43 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.63 
 
 		 310 aa  65.1  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.1 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  34.81 
 
 		 634 aa  61.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  30.13 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  30.06 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.39 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  33.77 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  33.77 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  33.77 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  42.03 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  32.26 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  44.12 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  32.87 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  26.71 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  26.63 
 
 		 216 aa  51.6  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  31.51 
 
 		 406 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  26.45 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  34.9 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  29.79 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  28.28 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  43.28 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  32.92 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  32.18 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  34.62 
 
 		 204 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  30.37 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  27.67 
 
 		 274 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 254 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 278 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  37.11 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  27.73 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  31.25 
 
 		 424 aa  47.4  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  28.06 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  30.11 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  27.21 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  36.36 
 
 		 361 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  38.36 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  38.67 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  26.57 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  37.04 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  26.92 
 
 		 327 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  28.89 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  35 
 
 		 511 aa  44.7  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  35.62 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  28.57 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 357 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 536 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  27.44 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  25 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  38.57 
 
 		 168 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  30.63 
 
 		 258 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  30.99 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0792  hypothetical protein  26.9 
 
 		 176 aa  42  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  34.94 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  27.7 
 
 		 327 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  24.66 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  29.14 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  28.99 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>