More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3562 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 177 aa  360  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  69.28 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  68.07 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 205 aa  130  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 		 195 aa  121  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  28.41 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  28.41 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  28.41 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  28.41 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  28.24 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.71 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  36.78 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  28 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  28.3 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  28.93 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  27.15 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  25.71 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  23.78 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  28.08 
 
 		 297 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  29.17 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  24.42 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  29.17 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  29.17 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  35.78 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 228 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 247 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  32.03 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  23.81 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  28.41 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 172 aa  51.6  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 234 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 231 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  29.03 
 
 		 227 aa  51.2  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  25.15 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  26.98 
 
 		 230 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  26.98 
 
 		 231 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  26.98 
 
 		 231 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  37.5 
 
 		 251 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  26.98 
 
 		 230 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 231 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  26.98 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.33 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.4 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  27.85 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.33 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  32.98 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  25.47 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>