100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0174 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1542    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  30.35 
 
 
1026 aa  239  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 
1240 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 
1553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  26.08 
 
 
902 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
972 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 
1481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.37 
 
 
1357 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  28.6 
 
 
1152 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  28.6 
 
 
1308 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
1032 aa  107  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  27.75 
 
 
1157 aa  107  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.37 
 
 
1617 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.42 
 
 
1510 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.12 
 
 
1733 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  27.44 
 
 
901 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
1046 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4962  hypothetical protein  26.79 
 
 
1136 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 
1760 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  25.33 
 
 
1073 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.78 
 
 
1609 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.51 
 
 
1686 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.22 
 
 
1194 aa  98.2  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  31.66 
 
 
969 aa  97.8  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
965 aa  97.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
897 aa  97.4  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  31.66 
 
 
969 aa  97.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.86 
 
 
1547 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
1078 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.99 
 
 
1711 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.88 
 
 
1190 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.79 
 
 
1398 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.42 
 
 
1623 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.7 
 
 
1684 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  26.58 
 
 
1699 aa  91.3  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 
994 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
1013 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 
1353 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.77 
 
 
1599 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 
1265 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.47 
 
 
1355 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 
1334 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.45 
 
 
1583 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.75 
 
 
1236 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.53 
 
 
1607 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.22 
 
 
1598 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
973 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  25.46 
 
 
1230 aa  80.9  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  28.77 
 
 
1392 aa  80.9  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  28.34 
 
 
1229 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 
1344 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  24.21 
 
 
1432 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
1085 aa  74.3  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.37 
 
 
1491 aa  72.8  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.36 
 
 
1823 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
1314 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  31.58 
 
 
1657 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  24.47 
 
 
1092 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  32.3 
 
 
659 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  26.44 
 
 
885 aa  69.3  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  24.75 
 
 
1075 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  48.15 
 
 
1152 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.77 
 
 
1075 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  45.71 
 
 
1264 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  24 
 
 
1089 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  45.71 
 
 
1264 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  23.88 
 
 
1067 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  25.43 
 
 
1080 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.44 
 
 
1399 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2012  WD-40 repeat-containing protein  25.3 
 
 
1236 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  23.53 
 
 
1089 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.09 
 
 
1063 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  37.5 
 
 
1102 aa  64.3  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  47.76 
 
 
1183 aa  64.3  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  23.99 
 
 
1075 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.83 
 
 
1626 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  27.84 
 
 
1124 aa  61.6  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
712 aa  61.6  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  27.8 
 
 
1424 aa  61.6  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  43.53 
 
 
1401 aa  60.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.72 
 
 
680 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.49 
 
 
1267 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  25.53 
 
 
1074 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  38.55 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2814  hypothetical protein  29.06 
 
 
1043 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  25.06 
 
 
1301 aa  58.9  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 
1005 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
1020 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
947 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 
1014 aa  54.7  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  36.11 
 
 
1092 aa  52  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.21 
 
 
1217 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
698 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.75 
 
 
1789 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.05 
 
 
1552 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.75 
 
 
1661 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6476  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
1187 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.5 
 
 
1211 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.4 
 
 
1714 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1037  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 
885 aa  44.3  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>