103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5262 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  100 
 
 		 1432 aa  2936    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1157 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1152 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 1078 aa  145  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1073 aa  135  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 		 973 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 972 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  30.05 
 
 		 902 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  24.94 
 
 		 1032 aa  132  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 		 1686 aa  130  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 		 1240 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 969 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 969 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  29.06 
 
 		 1699 aa  129  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.78 
 
 		 1623 aa  128  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.64 
 
 		 1733 aa  127  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 1334 aa  126  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.17 
 
 		 1599 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 		 1711 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 965 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 897 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 1013 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 1046 aa  122  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 1005 aa  121  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  26.38 
 
 		 1194 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.54 
 
 		 1357 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1265 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 		 1014 aa  116  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.63 
 
 		 1684 aa  116  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 1481 aa  116  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 901 aa  115  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 1353 aa  115  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  29.97 
 
 		 885 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.1 
 
 		 1607 aa  114  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.6 
 
 		 1609 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 		 1020 aa  112  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.85 
 
 		 1190 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.55 
 
 		 1583 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 		 1314 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1553 aa  108  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1026 aa  107  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.11 
 
 		 1236 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.39 
 
 		 1823 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.05 
 
 		 1617 aa  105  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  24.7 
 
 		 1308 aa  103  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 		 947 aa  99  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1355 aa  95.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.04 
 
 		 1760 aa  95.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 		 1344 aa  92.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  25.15 
 
 		 1092 aa  92  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  24.26 
 
 		 994 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1230 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 		 1085 aa  87.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  25.67 
 
 		 1089 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.09 
 
 		 1267 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  24.49 
 
 		 1089 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1491 aa  86.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.95 
 
 		 1398 aa  86.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  24.1 
 
 		 1075 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  25.46 
 
 		 1075 aa  83.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.99 
 
 		 1598 aa  82.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.71 
 
 		 1063 aa  82  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1392 aa  81.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1657 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.75 
 
 		 1547 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  22.28 
 
 		 1301 aa  78.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  24.53 
 
 		 1074 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1510 aa  75.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1401 aa  74.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  23.36 
 
 		 787 aa  74.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.28 
 
 		 1626 aa  71.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 698 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  29.91 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 1092 aa  63.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  44.62 
 
 		 1124 aa  62.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  44.59 
 
 		 1067 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2814  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1043 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  37.93 
 
 		 1131 aa  60.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  39.19 
 
 		 1424 aa  60.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  46.15 
 
 		 1075 aa  59.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 1080 aa  59.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1399 aa  59.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  38.27 
 
 		 1217 aa  59.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  41.18 
 
 		 1102 aa  58.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 1152 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.32 
 
 		 680 aa  56.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  42.37 
 
 		 1264 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  42.37 
 
 		 1264 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6476  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 1187 aa  52.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1229 aa  51.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 712 aa  51.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.93 
 
 		 1661 aa  51.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  39.34 
 
 		 1183 aa  50.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2012  WD-40 repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1236 aa  49.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.53 
 
 		 267 aa  48.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.39 
 
 		 1211 aa  48.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1091  WD-40 repeat-containing protein  21.48 
 
 		 1402 aa  48.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.95 
 
 		 272 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.35 
 
 		 290 aa  47  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1552 aa  46.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>