172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1091 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1091  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1402 aa  2826    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  44.19 
 
 		 1217 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  31.74 
 
 		 1229 aa  208  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2012  WD-40 repeat-containing protein  35.64 
 
 		 1236 aa  200  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.16 
 
 		 680 aa  172  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  31.57 
 
 		 659 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 712 aa  121  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.29 
 
 		 1357 aa  85.5  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2814  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1043 aa  82  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1510 aa  76.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1157 aa  76.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  24.22 
 
 		 1183 aa  75.1  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.07 
 
 		 1188 aa  75.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1553 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.72 
 
 		 696 aa  73.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.99 
 
 		 1481 aa  72.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 1221 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.2 
 
 		 806 aa  70.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.25 
 
 		 1177 aa  69.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  23.4 
 
 		 1334 aa  69.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22 
 
 		 1552 aa  69.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.28 
 
 		 1364 aa  68.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.01 
 
 		 1363 aa  68.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1211 aa  67.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1196 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.89 
 
 		 464 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1176 aa  66.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1190 aa  66.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1321  WD-40 repeat-containing protein  46.38 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.343905  normal  0.741087 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1026 aa  66.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.54 
 
 		 677 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.29 
 
 		 1072 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  26.91 
 
 		 885 aa  64.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.29 
 
 		 1072 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.73 
 
 		 1711 aa  62.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.72 
 
 		 630 aa  62.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.96 
 
 		 1348 aa  62.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.14 
 
 		 1344 aa  62  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 		 1686 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.71 
 
 		 1213 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 		 1190 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.74 
 
 		 1163 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.15 
 
 		 1901 aa  60.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 		 1760 aa  59.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.73 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.68 
 
 		 1652 aa  58.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.85 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1152 aa  58.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  19.47 
 
 		 1247 aa  58.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.19 
 
 		 947 aa  58.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1789 aa  58.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  25.98 
 
 		 790 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.2 
 
 		 898 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.27 
 
 		 742 aa  57.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.21 
 
 		 676 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.14 
 
 		 1831 aa  57.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1858 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  26.37 
 
 		 709 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.59 
 
 		 1240 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.81 
 
 		 1598 aa  57  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.36 
 
 		 943 aa  57  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.46 
 
 		 636 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.28 
 
 		 1236 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.51 
 
 		 1076 aa  55.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  21.89 
 
 		 1016 aa  55.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.45 
 
 		 1004 aa  55.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.52 
 
 		 692 aa  55.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 		 1411 aa  55.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.72 
 
 		 1656 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.29 
 
 		 1523 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.29 
 
 		 565 aa  55.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  21.64 
 
 		 1016 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.38 
 
 		 1599 aa  55.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.68 
 
 		 1443 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.24 
 
 		 740 aa  53.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1073 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  22.7 
 
 		 1373 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 511 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.53 
 
 		 1583 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.98 
 
 		 1557 aa  53.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.52 
 
 		 642 aa  53.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1474 aa  53.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.56 
 
 		 608 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.31 
 
 		 344 aa  53.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1355 aa  52.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.15 
 
 		 434 aa  52.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 		 1279 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 		 1279 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.31 
 
 		 682 aa  52.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1714 aa  52.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.72 
 
 		 1193 aa  52.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 		 1209 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27.14 
 
 		 902 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 		 1208 aa  52  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  34.71 
 
 		 335 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  21.58 
 
 		 1477 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.19 
 
 		 1609 aa  51.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 		 1264 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 		 1264 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.09 
 
 		 1267 aa  51.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>