274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2012 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2012  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1236 aa  2462    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  42.48 
 
 		 1217 aa  254  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1229 aa  227  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1091  WD-40 repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1402 aa  200  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  30.71 
 
 		 659 aa  145  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.5 
 
 		 680 aa  141  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 		 1583 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 1598 aa  115  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 712 aa  113  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.95 
 
 		 1626 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.04 
 
 		 1398 aa  101  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.58 
 
 		 1547 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  25.99 
 
 		 1733 aa  95.1  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  21.83 
 
 		 1553 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.4 
 
 		 1163 aa  88.2  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.67 
 
 		 1280 aa  86.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 1373 aa  85.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.93 
 
 		 943 aa  84.7  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  21.89 
 
 		 1789 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.9 
 
 		 1334 aa  83.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.26 
 
 		 947 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1211 aa  82  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  28.98 
 
 		 1157 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.91 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.57 
 
 		 464 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.71 
 
 		 1357 aa  77.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.57 
 
 		 1364 aa  75.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 1046 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.33 
 
 		 1004 aa  75.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1152 aa  76.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.28 
 
 		 1607 aa  75.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.85 
 
 		 1901 aa  75.5  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1858 aa  75.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.23 
 
 		 1363 aa  75.1  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  28.46 
 
 		 511 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.88 
 
 		 1190 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.22 
 
 		 1523 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  24.41 
 
 		 1264 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.27 
 
 		 1652 aa  73.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  24.41 
 
 		 1264 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.98 
 
 		 1609 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.16 
 
 		 1823 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.78 
 
 		 1443 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  26.45 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  25.09 
 
 		 1183 aa  71.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.55 
 
 		 564 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.62 
 
 		 1623 aa  70.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.18 
 
 		 742 aa  70.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.65 
 
 		 919 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 1247 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 972 aa  69.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 		 1344 aa  68.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 1557 aa  68.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.1 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.49 
 
 		 576 aa  68.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.47 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  27.23 
 
 		 1311 aa  68.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  24.26 
 
 		 902 aa  68.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.22 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1041 aa  68.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.66 
 
 		 1454 aa  68.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  30.57 
 
 		 652 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.53 
 
 		 1411 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  27.35 
 
 		 589 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1236 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.61 
 
 		 1711 aa  67.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.82 
 
 		 737 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  25.97 
 
 		 433 aa  67  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1214 aa  66.6  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  29.57 
 
 		 522 aa  67  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.89 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.62 
 
 		 676 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.16 
 
 		 828 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27.62 
 
 		 696 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 		 1190 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.7 
 
 		 1760 aa  66.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  24.46 
 
 		 687 aa  65.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.63 
 
 		 1481 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.67 
 
 		 865 aa  65.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1355 aa  65.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  23.11 
 
 		 1078 aa  65.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.4 
 
 		 1267 aa  65.1  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.7 
 
 		 898 aa  65.1  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  30.6 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  28.06 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.02 
 
 		 833 aa  65.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.36 
 
 		 716 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.44 
 
 		 1188 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  25.3 
 
 		 787 aa  64.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 1686 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 		 1240 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 1221 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1477 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1190 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.92 
 
 		 608 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.91 
 
 		 344 aa  64.3  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 		 1193 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.74 
 
 		 574 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.55 
 
 		 443 aa  64.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 973 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>