More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1415 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  77.57 
 
 		 1075 aa  1659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  79.03 
 
 		 1089 aa  1720    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  78.85 
 
 		 1089 aa  1716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  57.7 
 
 		 1131 aa  1088    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 1092 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  47.08 
 
 		 1124 aa  950    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  77.73 
 
 		 1063 aa  1669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  78.42 
 
 		 1075 aa  1667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  58.89 
 
 		 1102 aa  1290    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  78.39 
 
 		 1080 aa  1660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  50.65 
 
 		 1074 aa  1021    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  78.05 
 
 		 1075 aa  1669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  77.74 
 
 		 1067 aa  1670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 1092 aa  2238    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 973 aa  144  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.22 
 
 		 1194 aa  144  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 		 1078 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.41 
 
 		 1823 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1157 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 972 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.24 
 
 		 1190 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 		 1032 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1073 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.92 
 
 		 1607 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.88 
 
 		 1357 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 		 1344 aa  118  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1399 aa  118  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.73 
 
 		 1598 aa  117  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 		 1353 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 1334 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.1 
 
 		 1583 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1265 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 1046 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  26.69 
 
 		 1308 aa  112  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 		 969 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 		 969 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 965 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 897 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  27.13 
 
 		 1699 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.85 
 
 		 1599 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  24.69 
 
 		 902 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1152 aa  109  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.89 
 
 		 1684 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03461  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 205 aa  108  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  25.66 
 
 		 885 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 1013 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.6 
 
 		 1481 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.56 
 
 		 1240 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.86 
 
 		 1236 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.1 
 
 		 1617 aa  99.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  26.91 
 
 		 901 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1657 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.59 
 
 		 986 aa  97.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1355 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 1314 aa  96.3  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1553 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1510 aa  95.1  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.18 
 
 		 1609 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.57 
 
 		 1686 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1432 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  25.89 
 
 		 994 aa  92  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1392 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  26.84 
 
 		 1301 aa  89.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.38 
 
 		 1547 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1026 aa  89.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  23.75 
 
 		 539 aa  87.4  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  38.78 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.56 
 
 		 1760 aa  84.7  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 947 aa  84  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1401 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1230 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.79 
 
 		 1711 aa  82.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  25.06 
 
 		 1085 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.07 
 
 		 1267 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.65 
 
 		 1623 aa  78.2  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 		 1014 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 		 1005 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  26.09 
 
 		 1733 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 		 1020 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.88 
 
 		 1398 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 1020 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  34.62 
 
 		 512 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 928 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.1 
 
 		 961 aa  71.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  33.65 
 
 		 512 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  33.65 
 
 		 512 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.65 
 
 		 512 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.65 
 
 		 512 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.65 
 
 		 512 aa  71.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.65 
 
 		 512 aa  71.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  33.65 
 
 		 512 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  38 
 
 		 711 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  34.55 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.57 
 
 		 514 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  35.09 
 
 		 729 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2758  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.45 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2820  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.45 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0342818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.45 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  22.4 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2713  transcriptional activator CadC  36.45 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>