More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1544 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  76.68 
 
 
1075 aa  1679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 
1089 aa  2234    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  40.34 
 
 
1092 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  53.31 
 
 
1131 aa  1119    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  47.97 
 
 
1124 aa  981    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  75.49 
 
 
1063 aa  1622    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  76.68 
 
 
1075 aa  1668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  60 
 
 
1102 aa  1338    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  82.23 
 
 
1075 aa  1755    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  77.18 
 
 
1080 aa  1682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  51.25 
 
 
1074 aa  1037    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  98.9 
 
 
1089 aa  2217    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  83.35 
 
 
1067 aa  1805    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  79.03 
 
 
1092 aa  1720    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
973 aa  148  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.02 
 
 
1194 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 
1078 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.2 
 
 
1823 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
1032 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.42 
 
 
1607 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 
972 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.68 
 
 
1547 aa  121  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  28.51 
 
 
1157 aa  121  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 
1334 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
969 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
969 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.15 
 
 
1357 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  27.57 
 
 
1073 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
965 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
897 aa  118  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 
1399 aa  118  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.45 
 
 
1190 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.82 
 
 
1598 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.24 
 
 
1344 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  26.68 
 
 
1265 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
1046 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 
1353 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.25 
 
 
1583 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  27.13 
 
 
1699 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  25.58 
 
 
1308 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  25.89 
 
 
902 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03461  transcriptional regulator  40.41 
 
 
205 aa  108  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
1013 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  25.66 
 
 
885 aa  108  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.11 
 
 
1398 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.39 
 
 
1236 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.89 
 
 
1684 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  27.79 
 
 
1152 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 
1481 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.53 
 
 
1599 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  27.7 
 
 
1355 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 
1510 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.73 
 
 
1240 aa  99  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  27.19 
 
 
994 aa  98.6  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
1617 aa  97.8  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.65 
 
 
986 aa  97.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  27.7 
 
 
901 aa  97.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
1314 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.59 
 
 
1626 aa  96.3  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.52 
 
 
1686 aa  95.9  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  24.48 
 
 
539 aa  95.1  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  23.85 
 
 
1026 aa  94.7  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.6 
 
 
1609 aa  94  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  25.24 
 
 
1392 aa  92.8  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.11 
 
 
1657 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.46 
 
 
1553 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  41.84 
 
 
412 aa  92.8  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.27 
 
 
1711 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  25.67 
 
 
1432 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  25.26 
 
 
1301 aa  82.8  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.1 
 
 
1760 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 
947 aa  82.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  34.64 
 
 
1020 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  31.08 
 
 
928 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3319  transcriptional regulatory protein-like protein  39.6 
 
 
691 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.389048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  23.55 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  25.48 
 
 
1401 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  35.58 
 
 
512 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  25.69 
 
 
1733 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  34.62 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  34.62 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  34.62 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  34.62 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  34.62 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  34.62 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  34.62 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  23.38 
 
 
1230 aa  75.5  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.03 
 
 
1623 aa  75.1  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26 
 
 
1267 aa  75.1  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  24.14 
 
 
1005 aa  74.7  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  39.78 
 
 
693 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  35.83 
 
 
711 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 
1014 aa  73.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.57 
 
 
961 aa  73.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 
1020 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  45 
 
 
520 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  39.13 
 
 
945 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  32.61 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  35.45 
 
 
762 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  34.78 
 
 
729 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.178679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>