96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1427 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1427  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2539  2OG-Fe(II) oxygenase  62.13 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1234  normal  0.466167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3292  2OG-Fe(II) oxygenase  54.5 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4443  alkylated DNA repair protein  56.6 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000774042  decreased coverage  0.000155018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06510  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  51.44 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3551  2OG-Fe(II) oxygenase  51.36 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.686073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0402  2OG-Fe(II) oxygenase  48.39 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21790  alkylated DNA repair protein  49.77 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000653135  normal  0.245071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3810  2OG-Fe(II) oxygenase  44.19 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0523384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3256  2OG-Fe(II) oxygenase  40.2 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3972  2OG-Fe(II) oxygenase  40.38 
 
 		 205 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0213  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.51 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0346  2OG-Fe(II) oxygenase  39.34 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3500  2OG-Fe(II) oxygenase  39.25 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1922  2OG-Fe(II) oxygenase  41.86 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4299  2OG-Fe(II) oxygenase  37.5 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0011  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  34.62 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0179424  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0002  2OG-Fe(II) oxygenase  37.56 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.691503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3595  2OG-Fe(II) oxygenase  39.07 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1690  2OG-Fe(II) oxygenase  37.74 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3576  2OG-Fe(II) oxygenase  42.57 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0466408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1751  2OG-Fe(II) oxygenase  39.71 
 
 		 219 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2936  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  38.86 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.443338  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2016  2OG-Fe(II) oxygenase  39.53 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2434  2OG-Fe(II) oxygenase  41.76 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3572  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB  37.81 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4097  2OG-Fe(II) oxygenase  37.8 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1006  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  35.87 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.301946  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0533  alkylated DNA repair protein AlkB  38.21 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2104  2OG-Fe(II) oxygenase  41.07 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0116  2OG-Fe(II) oxygenase  33.49 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.844541  normal  0.456878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0463  alkylated DNA repair protein AlkB  38.28 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2549  2OG-Fe(II) oxygenase  39.37 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4875  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.18 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5103  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.42 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0451  2OG-Fe(II) oxygenase  37.21 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.04408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3988  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  44.05 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3002  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  43.2 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4016  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2840  2OG-Fe(II) oxygenase  40.59 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2361  alkylated DNA repair protein AlkB  39.88 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3751  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  44.05 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.945805  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2792  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.72 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3400  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2363  2OG-Fe(II) oxygenase  38.01 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1446  alkylated DNA repair protein AlkB  38.69 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2351  alkylated DNA repair protein AlkB  38.69 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3769  alkylated DNA repair protein alk  40.12 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2511  alkylated DNA repair protein AlkB  39.29 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3350  alkylated DNA repair protein AlkB  39.29 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02139  oxidative demethylase of N1-methyladenine or N3-methylcytosine DNA lesions  39.29 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.717739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02098  hypothetical protein  39.29 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.638508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1438  alkylated DNA repair protein AlkB  39.29 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.173238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0728  alkylated DNA repair protein AlkB  39.29 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451763  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2607  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.42 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.57435 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3793  2OG-Fe(II) oxygenase  36.77 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2504  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.88 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538905  hitchhiker  0.000448771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4927  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.86 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2400  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.88 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4650  2OG-Fe(II) oxygenase  40.48 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2448  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.42 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.177895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2490  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.42 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3574  2OG-Fe(II) oxygenase  37.02 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.691383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1301  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.61 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.290458  normal  0.0238638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3161  2OG-Fe(II) oxygenase  34.27 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0794  2OG-Fe(II) oxygenase  36.9 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2568  alkylated DNA repair protein  42.86 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3795  2OG-Fe(II) oxygenase  42.94 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0190122  normal  0.423081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3253  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2937  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  37.5 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.885345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1028  2OG-Fe(II) oxygenase  36.9 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4921  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  38.12 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2476  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5268  N1-methyladenine/N3-methylcytosine demethylase  40.12 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.534541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1781  2OG-Fe(II) oxygenase  37.72 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3182  2OG-Fe(II) oxygenase  38.18 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.191143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0631  2OG-Fe(II) oxygenase  39.52 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0652  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  39.52 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1198  2OG-Fe(II) oxygenase  36.97 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2985  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  38.82 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3118  DNA alkylation damage repair protein AlkB  37.65 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101889  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46782  predicted protein  32.37 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.211133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0549  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.21 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01450  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33669  predicted protein  35.94 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.0171071 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03958  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_6G07990)  34.94 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310797  normal  0.0264233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  33.58 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0979  2OG-Fe(II) oxygenase  27.75 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.716727  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  28.39 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  26.8 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.67 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  29.68 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9147  predicted protein  29.45 
 
 		 134 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0742742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>