87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2015 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
192 aa  361  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  88.89 
 
 
192 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  87.83 
 
 
204 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  42.16 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  43.55 
 
 
191 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  45.99 
 
 
191 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  43.23 
 
 
199 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  42.02 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  40.68 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  43.24 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  38.41 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  31.35 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  33.85 
 
 
343 aa  71.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  34.39 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  28.19 
 
 
202 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  29.93 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2937  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  28.68 
 
 
220 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.885345  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000801  alkylated DNA repair protein  26.39 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000943917  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0575  DNA repair system specific for alkylated DNA  34.59 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.33 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0624  alkylated DNA repair protein  34.59 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.137834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5067  2OG-Fe(II) oxygenase  26.22 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.0349586 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2400  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.27 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104047  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3002  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  31.87 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2504  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.27 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538905  hitchhiker  0.000448771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2490  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  34.27 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2607  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  33.57 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.57435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  27.05 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  31.37 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2448  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  33.57 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.177895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3161  2OG-Fe(II) oxygenase  33.06 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1341  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.85 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.80983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0967  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.85 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1300  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.85 
 
 
208 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0601  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.85 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0998792  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0324  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.85 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1228  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.85 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2489  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  32.85 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  22.73 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 
202 aa  48.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  25.69 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1446  alkylated DNA repair protein AlkB  29.49 
 
 
216 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3350  alkylated DNA repair protein AlkB  29.68 
 
 
216 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2351  alkylated DNA repair protein AlkB  29.49 
 
 
216 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2511  alkylated DNA repair protein AlkB  29.68 
 
 
216 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0728  alkylated DNA repair protein AlkB  29.68 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02098  hypothetical protein  29.68 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.638508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1438  alkylated DNA repair protein AlkB  29.68 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.173238 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06700  hypothetical protein  27.46 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4097  2OG-Fe(II) oxygenase  28.93 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.797242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02139  oxidative demethylase of N1-methyladenine or N3-methylcytosine DNA lesions  29.68 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.717739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1690  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0153  hypothetical protein  19.71 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  26.71 
 
 
209 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  34.41 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2104  2OG-Fe(II) oxygenase  31.16 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  28.66 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2792  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  30.14 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1006  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.79 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.301946  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0213  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2434  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1922  2OG-Fe(II) oxygenase  29.29 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0979  2OG-Fe(II) oxygenase  29.61 
 
 
255 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.716727  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3988  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  34.29 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2936  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  33.09 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.443338  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3769  alkylated DNA repair protein alk  28.57 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  27.2 
 
 
335 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4217  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.28 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4650  2OG-Fe(II) oxygenase  31.91 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  24.32 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03179  DNA repair system specific for alkylated DNA  28.57 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2361  alkylated DNA repair protein AlkB  28.21 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  30.94 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2840  2OG-Fe(II) oxygenase  31.97 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2985  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.78 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3256  2OG-Fe(II) oxygenase  29.65 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1259  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.51 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.802283  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3500  2OG-Fe(II) oxygenase  28.82 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21790  alkylated DNA repair protein  34.91 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000653135  normal  0.245071 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03958  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_6G07990)  27.13 
 
 
359 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310797  normal  0.0264233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  23.81 
 
 
202 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3118  DNA alkylation damage repair protein AlkB  28.99 
 
 
228 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0448  2OG-Fe(II) oxygenase  25.53 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3770  alkylated DNA repair protein-like protein  24.55 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>