33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5174 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  70.05 
 
 		 191 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  65.95 
 
 		 191 aa  259  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  57.47 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  51.72 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  50 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  43.39 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  42.16 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  43.78 
 
 		 192 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  38.62 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  43.78 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  30.32 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  29.84 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21790  alkylated DNA repair protein  26.06 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000653135  normal  0.245071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  33.05 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  25.71 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  26.03 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  26.32 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  26.03 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5067  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.0349586 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3551  2OG-Fe(II) oxygenase  25.36 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.686073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2400  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  32.76 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2490  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  32.76 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2504  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  33.9 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538905  hitchhiker  0.000448771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2448  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  31.9 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.177895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2607  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  31.9 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.57435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06510  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  23.83 
 
 		 223 aa  42  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  31.31 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  29 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>