30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1364 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  57.47 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  59.88 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  55.26 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  52.51 
 
 		 196 aa  197  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  52.81 
 
 		 215 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  47.18 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  43.23 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  44.79 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  40.34 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  46.35 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  29.47 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  29.47 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  29.45 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  30.25 
 
 		 343 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1427  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  31.91 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3161  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46782  predicted protein  28.81 
 
 		 352 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.211133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2504  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  30.17 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538905  hitchhiker  0.000448771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21790  alkylated DNA repair protein  27.85 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000653135  normal  0.245071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2607  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  29.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.57435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2400  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  30.17 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2448  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  29.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.177895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2490  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  29.31 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  27.4 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  27.93 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1690  2OG-Fe(II) oxygenase  29.3 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>