44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0869 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  47.57 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  47.18 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  48.11 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  43.39 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  40.62 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  40.31 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  42.02 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  44.38 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  44.21 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  35.29 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  31.61 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  29.09 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  32.34 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3350  alkylated DNA repair protein AlkB  26.42 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0728  alkylated DNA repair protein AlkB  26.42 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1438  alkylated DNA repair protein AlkB  26.42 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.173238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1446  alkylated DNA repair protein AlkB  26.42 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02098  hypothetical protein  26.42 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.638508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02139  oxidative demethylase of N1-methyladenine or N3-methylcytosine DNA lesions  26.42 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.717739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2351  alkylated DNA repair protein AlkB  26.42 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0533  alkylated DNA repair protein AlkB  27.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478593  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0463  alkylated DNA repair protein AlkB  27.91 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1006  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.84 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.301946  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2511  alkylated DNA repair protein AlkB  25.91 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2361  alkylated DNA repair protein AlkB  25.91 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3793  2OG-Fe(II) oxygenase  28.8 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3574  2OG-Fe(II) oxygenase  25.9 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.691383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3161  2OG-Fe(II) oxygenase  34.74 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2104  2OG-Fe(II) oxygenase  27.65 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2936  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  35.48 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.443338  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2792  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  26.9 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1922  2OG-Fe(II) oxygenase  30.14 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1690  2OG-Fe(II) oxygenase  35.48 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  32.5 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4097  2OG-Fe(II) oxygenase  35.48 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  27.65 
 
 		 343 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2840  2OG-Fe(II) oxygenase  30.43 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5103  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  33.64 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2985  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.58 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  26.32 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2434  2OG-Fe(II) oxygenase  28.99 
 
 		 218 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5268  N1-methyladenine/N3-methylcytosine demethylase  32.41 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.534541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>