16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2807 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  38.62 
 
 		 191 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  41.24 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  40.34 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  38.71 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  44.63 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  39.25 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  39.58 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  38.02 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  36.32 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  44.07 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  25.63 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  29.41 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  29.56 
 
 		 343 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2351  alkylated DNA repair protein AlkB  29.86 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>