95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1948 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  94.79 
 
 		 192 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  87.83 
 
 		 192 aa  312  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  43.78 
 
 		 191 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  46.35 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  47.19 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  42.7 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  44.21 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  44.57 
 
 		 215 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  43.5 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  42.16 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  38 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  31.84 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  32.85 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  31.85 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  28.95 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.34 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0575  DNA repair system specific for alkylated DNA  36.09 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0624  alkylated DNA repair protein  36.09 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.137834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  29.53 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000801  alkylated DNA repair protein  30.28 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000943917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03179  DNA repair system specific for alkylated DNA  32.97 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  31.85 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2937  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.63 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.885345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3161  2OG-Fe(II) oxygenase  35.83 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06700  hypothetical protein  30.66 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1438  alkylated DNA repair protein AlkB  30.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.173238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0728  alkylated DNA repair protein AlkB  30.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451763  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02139  oxidative demethylase of N1-methyladenine or N3-methylcytosine DNA lesions  30.77 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.717739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2511  alkylated DNA repair protein AlkB  30.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2351  alkylated DNA repair protein AlkB  30.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02098  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.638508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1690  2OG-Fe(II) oxygenase  34.04 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1446  alkylated DNA repair protein AlkB  30.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3350  alkylated DNA repair protein AlkB  30.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5067  2OG-Fe(II) oxygenase  26.83 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.0349586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0979  2OG-Fe(II) oxygenase  30.39 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.716727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  25.17 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2400  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  33.57 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2490  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  33.57 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2504  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  33.57 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538905  hitchhiker  0.000448771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  24.32 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2448  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  32.86 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.177895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2361  alkylated DNA repair protein AlkB  30.13 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.49 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1341  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.80983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0601  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0998792  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0324  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2607  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  32.86 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.57435 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0967  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1300  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1228  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2489  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1922  2OG-Fe(II) oxygenase  31.39 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  28.08 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  24.68 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2792  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  30.34 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0153  hypothetical protein  20.19 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1006  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.61 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.301946  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  31.65 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.3 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  25.5 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3770  alkylated DNA repair protein-like protein  26.36 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  26.92 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4097  2OG-Fe(II) oxygenase  33.09 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4217  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.87 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2104  2OG-Fe(II) oxygenase  30.08 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0213  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.57 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3002  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.67 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1198  2OG-Fe(II) oxygenase  35 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4650  2OG-Fe(II) oxygenase  30.82 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4016  2OG-Fe(II) oxygenase  41.03 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2547  2OG-Fe(II) oxygenase  34.46 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3988  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.07 
 
 		 224 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2936  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.61 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.443338  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2985  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.87 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4109  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3793  2OG-Fe(II) oxygenase  33.81 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4574  2OG-Fe(II) oxygenase  31.5 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  hitchhiker  0.00000945237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2434  2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1815  hypothetical protein  30.41 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  27.4 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  28 
 
 		 335 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3118  DNA alkylation damage repair protein AlkB  30.66 
 
 		 228 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1963  2OG-Fe(II) oxygenase  27.27 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0652  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  33.06 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0448  2OG-Fe(II) oxygenase  25.81 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5103  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185091  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46782  predicted protein  29.27 
 
 		 352 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.211133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2055  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  26.67 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577188  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1802  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  25.55 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.431836  normal  0.363902 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0533  alkylated DNA repair protein AlkB  28.79 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>