66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5365 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  51.49 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  48.63 
 
 
197 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  39.04 
 
 
343 aa  111  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0488535 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  31.61 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  31.35 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  31.05 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  30.21 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  30.32 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  29.72 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  28.64 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04070  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
256 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0477628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1690  2OG-Fe(II) oxygenase  32.7 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86981  predicted protein  27.8 
 
 
347 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3500  2OG-Fe(II) oxygenase  28.05 
 
 
204 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2985  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.36 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3793  2OG-Fe(II) oxygenase  26.9 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3574  2OG-Fe(II) oxygenase  31.01 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.691383  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1198  2OG-Fe(II) oxygenase  31.65 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21790  alkylated DNA repair protein  31.07 
 
 
228 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000653135  normal  0.245071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0794  2OG-Fe(II) oxygenase  26.55 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5067  2OG-Fe(II) oxygenase  26.23 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.0349586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2363  2OG-Fe(II) oxygenase  24.86 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  26.8 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0944  2OG-Fe(II) oxygenase  24.88 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0533  alkylated DNA repair protein AlkB  26.42 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4299  2OG-Fe(II) oxygenase  25.46 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4016  2OG-Fe(II) oxygenase  25.79 
 
 
216 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0463  alkylated DNA repair protein AlkB  26.42 
 
 
199 aa  44.7  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  28.95 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1028  2OG-Fe(II) oxygenase  26.55 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2361  alkylated DNA repair protein AlkB  29.37 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2016  2OG-Fe(II) oxygenase  27.11 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3769  alkylated DNA repair protein alk  27.22 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1006  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  25.38 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.301946  normal  0.0506876 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  33.33 
 
 
335 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3253  2OG-Fe(II) oxygenase  26.45 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3118  DNA alkylation damage repair protein AlkB  27.39 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101889  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50302  predicted protein  27.18 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1061  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.71 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0885098  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1781  2OG-Fe(II) oxygenase  28.12 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2936  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.56 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.443338  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2476  2OG-Fe(II) oxygenase  25.81 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3978  2OG-Fe(II) oxygenase  32.08 
 
 
226 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0084294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3161  2OG-Fe(II) oxygenase  26.79 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  24.76 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4109  2OG-Fe(II) oxygenase  32.71 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3400  2OG-Fe(II) oxygenase  24.29 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3292  2OG-Fe(II) oxygenase  25.49 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0082  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  37.33 
 
 
205 aa  42  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3595  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
217 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4443  alkylated DNA repair protein  25.37 
 
 
213 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000774042  decreased coverage  0.000155018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0088  2OG-Fe(II) oxygenase  32.38 
 
 
208 aa  42  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2104  2OG-Fe(II) oxygenase  27.95 
 
 
216 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3751  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  30.19 
 
 
234 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.945805  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4574  2OG-Fe(II) oxygenase  32.71 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  hitchhiker  0.00000945237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 
202 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  33.02 
 
 
212 aa  42  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2549  2OG-Fe(II) oxygenase  28.18 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1751  2OG-Fe(II) oxygenase  29.38 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4097  2OG-Fe(II) oxygenase  28.47 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  24.88 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>