26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6864 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  70.05 
 
 
191 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  69.73 
 
 
191 aa  260  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  55.26 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  49.18 
 
 
215 aa  188  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  48.63 
 
 
196 aa  187  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  48.11 
 
 
202 aa  167  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  43.55 
 
 
192 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  42.7 
 
 
192 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  38.17 
 
 
202 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  42.7 
 
 
204 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  24.75 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  28.57 
 
 
343 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  29.2 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  26.8 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  28.07 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3624  2OG-Fe(II) oxygenase  31.18 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  29.63 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06510  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  25.22 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  30.49 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  31.09 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  29.6 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  31.63 
 
 
202 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>