58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2222 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  76.29 
 
 		 196 aa  308  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  49.18 
 
 		 191 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  52.81 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  49.43 
 
 		 191 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  40.62 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  43.24 
 
 		 192 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  43.48 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  39.58 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  44.57 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  28.88 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  32.17 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  33.88 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0853  alkylated DNA repair protein  31.45 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487927  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  27.53 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  28.95 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  33.66 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4807  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143026  hitchhiker  0.00100646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0935  2OG-Fe(II) oxygenase  31.5 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1963  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  28.47 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4109  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3568  2OG-Fe(II) oxygenase  29.92 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  hitchhiker  0.00000945237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  28.93 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5080  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.368788  normal  0.341703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0933  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.13 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.521325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  29.5 
 
 		 343 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  31.03 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0969  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.13 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1852  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  30.71 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  normal  0.0270125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3371  Alkylated DNA repair protein-like protein  29.92 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.647547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  29.59 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.16 
 
 		 141 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  27.63 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0845  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.91 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0919  2OG-Fe(II) oxygenase  29.13 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3106  2OG-Fe(II) oxygenase  26.89 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4217  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.64 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812072  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0153  hypothetical protein  27.97 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5584  2OG-Fe(II) oxygenase  27.32 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113591 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3800  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  24.52 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.173754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3978  2OG-Fe(II) oxygenase  29.93 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0084294 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  29.59 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4716  2OG-Fe(II) oxygenase  27.75 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3651  2OG-Fe(II) oxygenase  27.75 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13141  alkylated DNA repair protein  29.51 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.249611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3793  2OG-Fe(II) oxygenase  26.05 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  29.59 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3443  2OG-Fe(II) oxygenase  28.35 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  30.23 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  27.59 
 
 		 210 aa  42  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1061  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.71 
 
 		 214 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0885098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  30.21 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  28.69 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>