57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5200 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  76.29 
 
 		 215 aa  308  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  52.51 
 
 		 199 aa  197  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  51.72 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  48.63 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  48.85 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  40.31 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  42.16 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  38.02 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  47.86 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  25.84 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  27.81 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  30.34 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0853  alkylated DNA repair protein  31.45 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487927  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3800  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  26.04 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.173754 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06424  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0845  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  28.93 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4217  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  22.65 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4807  2OG-Fe(II) oxygenase  30.16 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143026  hitchhiker  0.00100646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1963  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  25.52 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  31.43 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  30.39 
 
 		 343 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  27.69 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.58 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  31.78 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0935  2OG-Fe(II) oxygenase  31.4 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3568  2OG-Fe(II) oxygenase  29.75 
 
 		 232 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2936  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  30.54 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.443338  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  24.66 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  28.02 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3793  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  0.0181991 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04070  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0477628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5080  2OG-Fe(II) oxygenase  27.46 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.368788  normal  0.341703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  27.14 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  27.05 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1852  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  33.67 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  normal  0.0270125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0969  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.75 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3371  Alkylated DNA repair protein-like protein  29.75 
 
 		 246 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.647547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0933  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.75 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.521325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.08 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  hitchhiker  0.00000945237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0919  2OG-Fe(II) oxygenase  28.93 
 
 		 246 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4109  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0153  hypothetical protein  24 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3978  2OG-Fe(II) oxygenase  27 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0084294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3106  2OG-Fe(II) oxygenase  26.89 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3770  alkylated DNA repair protein-like protein  26.09 
 
 		 206 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51112  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5584  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 		 199 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0931  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.75 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2104  2OG-Fe(II) oxygenase  27.17 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  30 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  24.46 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  26.03 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>