24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3722 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3722  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6864  hypothetical protein  69.73 
 
 		 191 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5174  hypothetical protein  65.95 
 
 		 191 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1364  hypothetical protein  59.88 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2222  2OG-Fe(II) oxygenase  49.43 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.449878  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5200  2OG-Fe(II) oxygenase  48.85 
 
 		 196 aa  175  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0869  2OG-Fe(II) oxygenase  47.57 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2015  2OG-Fe(II) oxygenase  45.99 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1863  2OG-Fe(II) oxygenase  47.06 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2807  2OG-Fe(II) oxygenase  39.25 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1948  2OG-Fe(II) oxygenase  52.11 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185436  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88555  predicted protein  30.19 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0488535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3446  2OG-Fe(II) oxygenase  30.46 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4100  2OG-Fe(II) oxygenase  30.65 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  27.7 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  28.81 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  32.46 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0402  2OG-Fe(II) oxygenase  25.73 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1006  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  29.58 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.301946  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3770  alkylated DNA repair protein-like protein  23.61 
 
 		 206 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51112  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  25.34 
 
 		 202 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1963  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 208 aa  41.2  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>