134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1802 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1802  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  100 
 
 
194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.431836  normal  0.363902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0853  alkylated DNA repair protein  68.85 
 
 
211 aa  270  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13141  alkylated DNA repair protein  55.03 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.249611 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07531  alkylated DNA repair protein  48.94 
 
 
189 aa  204  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0198174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0979  2OG-Fe(II) oxygenase  48.72 
 
 
255 aa  160  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.716727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21250  hypothetical protein  41.76 
 
 
200 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1815  hypothetical protein  43.18 
 
 
200 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2547  2OG-Fe(II) oxygenase  46.5 
 
 
206 aa  148  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3106  2OG-Fe(II) oxygenase  46.79 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  42.59 
 
 
185 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0944  2OG-Fe(II) oxygenase  41.48 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3624  2OG-Fe(II) oxygenase  46.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  40.11 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3651  2OG-Fe(II) oxygenase  41.71 
 
 
212 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4716  2OG-Fe(II) oxygenase  41.71 
 
 
212 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  38.17 
 
 
199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5584  2OG-Fe(II) oxygenase  40.64 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1852  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.76 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  normal  0.0270125 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0088  2OG-Fe(II) oxygenase  42.11 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0448  2OG-Fe(II) oxygenase  39.01 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  42.86 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4807  2OG-Fe(II) oxygenase  39.67 
 
 
203 aa  131  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143026  hitchhiker  0.00100646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2055  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  39.08 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577188  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0969  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.58 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395263  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4109  2OG-Fe(II) oxygenase  40.86 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 
215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0935  2OG-Fe(II) oxygenase  44.52 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301635  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4574  2OG-Fe(II) oxygenase  40.86 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  hitchhiker  0.00000945237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1098  alkylated DNA repair protein  44.16 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0933  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.86 
 
 
219 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  38.65 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0082  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  41.76 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3568  2OG-Fe(II) oxygenase  39.34 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1061  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  39.78 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0885098  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  39.43 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3443  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 
244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1341  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.2 
 
 
208 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.80983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0931  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  41.29 
 
 
219 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0845  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40 
 
 
203 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0324  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.2 
 
 
208 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0601  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.2 
 
 
208 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0998792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0967  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.2 
 
 
208 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  34.66 
 
 
201 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2489  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  42.2 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1300  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.2 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1228  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.2 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3978  2OG-Fe(II) oxygenase  40.22 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03179  DNA repair system specific for alkylated DNA  38.04 
 
 
202 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0919  2OG-Fe(II) oxygenase  38.8 
 
 
246 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  40.74 
 
 
217 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  36.16 
 
 
202 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1506  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.86 
 
 
205 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3371  Alkylated DNA repair protein-like protein  42.86 
 
 
246 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.647547  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5080  2OG-Fe(II) oxygenase  39.88 
 
 
196 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.368788  normal  0.341703 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  40.11 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0624  alkylated DNA repair protein  36.46 
 
 
194 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.137834  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0575  DNA repair system specific for alkylated DNA  36.46 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3800  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.05 
 
 
200 aa  117  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.173754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  48.87 
 
 
141 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  37.14 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06700  hypothetical protein  40.24 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  32.56 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  37.89 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000801  alkylated DNA repair protein  40.68 
 
 
202 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000943917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03669  alkylated DNA repair protein  32.62 
 
 
213 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  31.74 
 
 
202 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0520  2OG-Fe(II) oxygenase  39.77 
 
 
195 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106876  normal  0.285035 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0326  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  38 
 
 
199 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00021613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0153  hypothetical protein  29.55 
 
 
208 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5209  2OG-Fe(II) oxygenase  32.24 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000059446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1963  2OG-Fe(II) oxygenase  30.43 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4217  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.16 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812072  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9147  predicted protein  41.41 
 
 
134 aa  93.6  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0742742 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  39.17 
 
 
335 aa  92.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3770  alkylated DNA repair protein-like protein  29.57 
 
 
206 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51112  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0294  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.32 
 
 
182 aa  92  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0644352  normal  0.158325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5067  2OG-Fe(II) oxygenase  27.41 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.0349586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4812  hypothetical protein  32.61 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1259  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  27.49 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.802283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11019  hypothetical protein  39.58 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156547  normal  0.479084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2216  putative alkylated DNA repair protein  29.19 
 
 
212 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.0170627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4657  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  28.99 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1921  hypothetical protein  29.73 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44026  predicted protein  31.97 
 
 
384 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4278  hypothetical protein  28.99 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4364  hypothetical protein  28.99 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0439299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5351  putative alkylated DNA repair protein  27.75 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568532  normal  0.707533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3958  putative alkylated DNA repair protein  29.89 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662565  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0671  putative alkylated DNA repair protein  25.79 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.22017  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00881  CUE domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15410)  31.82 
 
 
448 aa  56.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0002  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.691503  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1203  putative alkylated DNA repair protein  38.14 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397259  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4046  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  26.18 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2434  2OG-Fe(II) oxygenase  36.62 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11770  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  33.96 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109166  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3972  2OG-Fe(II) oxygenase  33.73 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02527  isochorismatase family protein family (AFU_orthologue; AFUA_3G14500)  24.48 
 
 
817 aa  51.6  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.674593  normal  0.39314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2137  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  35.85 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0179753  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3253  2OG-Fe(II) oxygenase  32.14 
 
 
217 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>