101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1203 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1203  putative alkylated DNA repair protein  100 
 
 		 208 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397259  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3958  putative alkylated DNA repair protein  64.59 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662565  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2216  putative alkylated DNA repair protein  65.05 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.0170627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11770  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  61.72 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2137  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  65.05 
 
 		 211 aa  240  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0185  hypothetical protein  61.54 
 
 		 207 aa  238  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3962  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  63.89 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.257753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11019  hypothetical protein  56.94 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156547  normal  0.479084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4278  hypothetical protein  55.98 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4364  hypothetical protein  55.98 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0439299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4657  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  55.5 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4812  hypothetical protein  55.87 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1921  hypothetical protein  54.46 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0802  putative alkylated DNA repair protein  58.13 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1653  putative alkylated DNA repair protein  46.83 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0671  putative alkylated DNA repair protein  38.28 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.22017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4046  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  38.16 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5351  putative alkylated DNA repair protein  44.03 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568532  normal  0.707533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2055  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  31.75 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577188  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1259  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.68 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.802283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07515  hypothetical protein  30.59 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000801  alkylated DNA repair protein  35.76 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000943917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1963  2OG-Fe(II) oxygenase  30.59 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0977  2OG-Fe(II) oxygenase  34.81 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177384  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0803  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  32.81 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06700  hypothetical protein  33.53 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5209  2OG-Fe(II) oxygenase  32.52 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000059446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0448  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0624  alkylated DNA repair protein  35.64 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.137834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03179  DNA repair system specific for alkylated DNA  33.15 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1374  2OG-Fe(II) oxygenase  29.78 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5584  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13141  alkylated DNA repair protein  33.16 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.249611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3651  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4716  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2665  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.453825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3770  alkylated DNA repair protein-like protein  29.82 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4109  2OG-Fe(II) oxygenase  32.79 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2547  2OG-Fe(II) oxygenase  40.98 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4574  2OG-Fe(II) oxygenase  32.79 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  hitchhiker  0.00000945237 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0575  DNA repair system specific for alkylated DNA  34.04 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1061  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.79 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0885098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1487  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  31.58 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00541733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0979  2OG-Fe(II) oxygenase  37.7 
 
 		 255 aa  72  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.716727  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1341  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.15 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.80983  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0324  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.15 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0601  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.15 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0998792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1300  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.15 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0967  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.15 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  28.11 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3978  2OG-Fe(II) oxygenase  31.69 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0084294 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2489  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  32.61 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  27.22 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1228  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.61 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0845  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  28.81 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3800  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  28.22 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.173754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0520  2OG-Fe(II) oxygenase  38.25 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106876  normal  0.285035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  35.33 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1506  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.24 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1852  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  31.67 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  normal  0.0270125 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07531  alkylated DNA repair protein  29.09 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0198174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  29.61 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03669  alkylated DNA repair protein  28.65 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3435  2OG-Fe(II) oxygenase  40.23 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4807  2OG-Fe(II) oxygenase  33.7 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143026  hitchhiker  0.00100646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4217  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.14 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812072  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  37.23 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0326  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  34.67 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00021613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2994  putative alkylated DNA repair protein  31.21 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21250  hypothetical protein  32.43 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  42.55 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0294  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  31.64 
 
 		 182 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0644352  normal  0.158325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1815  hypothetical protein  32.79 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0944  2OG-Fe(II) oxygenase  39.08 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0082  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  26.74 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1572  2OG-Fe(II) oxygenase  25.3 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3624  2OG-Fe(II) oxygenase  37.93 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0153  hypothetical protein  25.41 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0088  2OG-Fe(II) oxygenase  26.04 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0853  alkylated DNA repair protein  40.21 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3106  2OG-Fe(II) oxygenase  35.71 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5080  2OG-Fe(II) oxygenase  28.95 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.368788  normal  0.341703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1098  alkylated DNA repair protein  37.93 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9147  predicted protein  32.31 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0742742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  24 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3568  2OG-Fe(II) oxygenase  33.67 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44026  predicted protein  29.8 
 
 		 384 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1802  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  38.14 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.431836  normal  0.363902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3443  2OG-Fe(II) oxygenase  33.04 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3371  Alkylated DNA repair protein-like protein  34.69 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.647547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0919  2OG-Fe(II) oxygenase  33.67 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1031  2OG-Fe(II) oxygenase  28.87 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0969  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.65 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0933  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.65 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.521325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0935  2OG-Fe(II) oxygenase  32.65 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0931  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.65 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5067  2OG-Fe(II) oxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.0349586 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14538  predicted protein  26.97 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144675  normal  0.121195 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26042  predicted protein  28.74 
 
 		 426 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0723901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>