99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4299 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4299  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3972  2OG-Fe(II) oxygenase  87.68 
 
 		 205 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3256  2OG-Fe(II) oxygenase  68.97 
 
 		 203 aa  289  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3500  2OG-Fe(II) oxygenase  67.82 
 
 		 204 aa  274  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0346  2OG-Fe(II) oxygenase  59.26 
 
 		 218 aa  227  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3810  2OG-Fe(II) oxygenase  56.5 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0523384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3002  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  53.73 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3572  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB  54.46 
 
 		 211 aa  204  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0451  2OG-Fe(II) oxygenase  52.13 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.04408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1751  2OG-Fe(II) oxygenase  51.49 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2016  2OG-Fe(II) oxygenase  54.55 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0116  2OG-Fe(II) oxygenase  51.44 
 
 		 215 aa  191  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.844541  normal  0.456878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0011  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  50.53 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0179424  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3576  2OG-Fe(II) oxygenase  47.24 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0466408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0213  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  50.51 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0002  2OG-Fe(II) oxygenase  49.75 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.691503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3595  2OG-Fe(II) oxygenase  44.33 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  45.5 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1690  2OG-Fe(II) oxygenase  44.68 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2104  2OG-Fe(II) oxygenase  46.07 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2936  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.65 
 
 		 217 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.443338  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2363  2OG-Fe(II) oxygenase  45.92 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2549  2OG-Fe(II) oxygenase  46.43 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3400  2OG-Fe(II) oxygenase  45.41 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4097  2OG-Fe(II) oxygenase  45.83 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2476  2OG-Fe(II) oxygenase  44.39 
 
 		 214 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1922  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1028  2OG-Fe(II) oxygenase  46.11 
 
 		 218 aa  147  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5268  N1-methyladenine/N3-methylcytosine demethylase  44.81 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.534541 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0533  alkylated DNA repair protein AlkB  44.21 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478593  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0463  alkylated DNA repair protein AlkB  44.21 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3118  DNA alkylation damage repair protein AlkB  43.78 
 
 		 228 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101889  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0631  2OG-Fe(II) oxygenase  45.08 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0652  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  45.08 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0728  alkylated DNA repair protein AlkB  42.86 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1438  alkylated DNA repair protein AlkB  42.86 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.173238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3350  alkylated DNA repair protein AlkB  42.86 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2511  alkylated DNA repair protein AlkB  42.33 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1446  alkylated DNA repair protein AlkB  42.86 
 
 		 216 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4875  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  45.11 
 
 		 217 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5103  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  43.92 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3795  2OG-Fe(II) oxygenase  45.21 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0190122  normal  0.423081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02098  hypothetical protein  42.33 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.638508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02139  oxidative demethylase of N1-methyladenine or N3-methylcytosine DNA lesions  42.33 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.717739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1301  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.5 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.290458  normal  0.0238638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2361  alkylated DNA repair protein AlkB  42.7 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2351  alkylated DNA repair protein AlkB  42.33 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0794  2OG-Fe(II) oxygenase  45.86 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3751  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  44.57 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.945805  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4016  2OG-Fe(II) oxygenase  42.63 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3574  2OG-Fe(II) oxygenase  42.7 
 
 		 212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.691383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2568  alkylated DNA repair protein  45.56 
 
 		 218 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2937  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  42.08 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.885345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3253  2OG-Fe(II) oxygenase  42.78 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3793  2OG-Fe(II) oxygenase  44.09 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2504  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  41.27 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538905  hitchhiker  0.000448771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2448  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  40.74 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.177895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2607  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  40.74 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.57435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1198  2OG-Fe(II) oxygenase  41.88 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2490  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  41.27 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2400  alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB  41.27 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4927  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  44.57 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2985  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  42.39 
 
 		 228 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1781  2OG-Fe(II) oxygenase  41.75 
 
 		 232 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1006  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.29 
 
 		 214 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.301946  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3182  2OG-Fe(II) oxygenase  41.85 
 
 		 217 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.191143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4650  2OG-Fe(II) oxygenase  43.01 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2792  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  41.08 
 
 		 216 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3769  alkylated DNA repair protein alk  42.08 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2434  2OG-Fe(II) oxygenase  41.53 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0549  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.21 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3988  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  40.96 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4921  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  41.71 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2840  2OG-Fe(II) oxygenase  40.54 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3161  2OG-Fe(II) oxygenase  40.98 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4443  alkylated DNA repair protein  40.49 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000774042  decreased coverage  0.000155018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3551  2OG-Fe(II) oxygenase  37.86 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.686073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3292  2OG-Fe(II) oxygenase  38.24 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21790  alkylated DNA repair protein  37.44 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000653135  normal  0.245071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1427  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  35.75 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06510  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  34.29 
 
 		 223 aa  93.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0402  2OG-Fe(II) oxygenase  47.52 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2539  2OG-Fe(II) oxygenase  47.52 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1234  normal  0.466167 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46782  predicted protein  39.02 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.211133  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01450  conserved hypothetical protein  34.83 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03958  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_6G07990)  29.41 
 
 		 359 aa  51.6  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310797  normal  0.0264233 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33669  predicted protein  31.19 
 
 		 348 aa  51.2  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.0171071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03179  DNA repair system specific for alkylated DNA  28.95 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30270  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily protein  26.9 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.685211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1701  2OG-Fe(II) oxygenase  29.73 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.194502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1802  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  36.27 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.431836  normal  0.363902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1109  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.89 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1654  2OG-Fe(II) oxygenase  27.89 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0520  2OG-Fe(II) oxygenase  27.04 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106876  normal  0.285035 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5365  2OG-Fe(II) oxygenase  25.46 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.146934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2055  DNA-N1-methyladenine dioxygenase  32.69 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577188  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0278  hypothetical protein  32.08 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0853  alkylated DNA repair protein  31.31 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487927  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07782  DNA repair family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14250)  32.11 
 
 		 335 aa  41.2  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701179  normal  0.593563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>