More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2249 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29731  putative urea ABC transporter  88.28 
 
 		 384 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2249  putative urea ABC transporter  100 
 
 		 384 aa  741    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19181  putative urea ABC transporter  73.51 
 
 		 385 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1047  putative urea ABC transporter  73.51 
 
 		 385 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.697374  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08871  putative urea ABC transporter  71.02 
 
 		 384 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08851  putative urea ABC transporter  71.02 
 
 		 384 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.527406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0828  putative urea ABC transporter  70.5 
 
 		 384 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2619  putative urea ABC transporter  55.47 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.268669  normal  0.387911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2863  urea ABC transporter, permease protein UrtB  57.47 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0129  inner-membrane translocator  55.15 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4362  inner-membrane translocator  54.1 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.084908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2259  urea ABC transporter, permease protein UrtB  57.44 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 542 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 542 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.86 
 
 		 545 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.76 
 
 		 537 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.31 
 
 		 550 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  41.21 
 
 		 520 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 529 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 540 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 537 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 534 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.96 
 
 		 523 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 524 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 547 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 526 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.68 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0227  Fis family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 537 aa  216  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.903114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.19 
 
 		 551 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  35.96 
 
 		 542 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 		 538 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 		 542 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.03 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.23 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  39.23 
 
 		 540 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.53 
 
 		 515 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 300 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 		 538 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 		 540 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  39.06 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  37.33 
 
 		 533 aa  206  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.39 
 
 		 545 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  37.05 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.44 
 
 		 543 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.17 
 
 		 543 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.05 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 537 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  35.92 
 
 		 307 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.67 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.6 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 527 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  38.16 
 
 		 538 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  35.43 
 
 		 543 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 554 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.6 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.27 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.8 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  36 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.17 
 
 		 308 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.27 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  37.4 
 
 		 551 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.5 
 
 		 543 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.81 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.81 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.81 
 
 		 308 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.7 
 
 		 304 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 553 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.83 
 
 		 539 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.58 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 592 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.1 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.26 
 
 		 549 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.16 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.68 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.22 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.34 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 526 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1437  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 525 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.16 
 
 		 539 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.26 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 539 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 542 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 542 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.92 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.16 
 
 		 539 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 		 542 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>