More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2863 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2863  urea ABC transporter, permease protein UrtB  100 
 
 		 388 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2259  urea ABC transporter, permease protein UrtB  73.18 
 
 		 386 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4362  inner-membrane translocator  69.97 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.084908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0129  inner-membrane translocator  69.15 
 
 		 386 aa  505  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29731  putative urea ABC transporter  57.4 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2249  putative urea ABC transporter  57.47 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1047  putative urea ABC transporter  56.89 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.697374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0828  putative urea ABC transporter  56.15 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08851  putative urea ABC transporter  56.41 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.527406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19181  putative urea ABC transporter  56.92 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08871  putative urea ABC transporter  56.41 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2619  putative urea ABC transporter  55.53 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.268669  normal  0.387911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  43.19 
 
 		 526 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  43.98 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  43.72 
 
 		 524 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.52 
 
 		 528 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.82 
 
 		 515 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  42.37 
 
 		 534 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.69 
 
 		 292 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  41.6 
 
 		 545 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 527 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  40.22 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 500 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 		 529 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 529 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.67 
 
 		 549 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  40.22 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.67 
 
 		 552 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.05 
 
 		 539 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.11 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.78 
 
 		 539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 553 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.67 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.15 
 
 		 543 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.84 
 
 		 539 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 539 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.57 
 
 		 539 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 539 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 539 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 		 529 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.57 
 
 		 539 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.15 
 
 		 543 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.22 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 526 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.84 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.84 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 		 538 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 		 540 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 		 542 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 		 542 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 		 542 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.83 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  40.88 
 
 		 538 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 542 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.94 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.23 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.5 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.42 
 
 		 561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 522 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.16 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 		 293 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.67 
 
 		 296 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  39.23 
 
 		 533 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.23 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  38.73 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  38.95 
 
 		 515 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2252  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.4 
 
 		 543 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  38.48 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.17 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.12 
 
 		 543 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5580  branched-chain amino acid ABC transporter permease  42.24 
 
 		 529 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0993  inner-membrane translocator  39.95 
 
 		 592 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.9 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 301 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.95 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0189  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 567 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 300 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.96 
 
 		 297 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.75 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.95 
 
 		 308 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 639 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1437  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 525 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.42 
 
 		 308 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 294 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  39.03 
 
 		 642 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 642 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.95 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  43 
 
 		 547 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.02 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>