More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_19181 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1047  putative urea ABC transporter  99.22 
 
 		 385 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.697374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19181  putative urea ABC transporter  100 
 
 		 385 aa  747    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08871  putative urea ABC transporter  78.7 
 
 		 384 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0828  putative urea ABC transporter  78.18 
 
 		 384 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08851  putative urea ABC transporter  78.44 
 
 		 384 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.527406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29731  putative urea ABC transporter  74.81 
 
 		 384 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2249  putative urea ABC transporter  73.51 
 
 		 384 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2619  putative urea ABC transporter  54.64 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.268669  normal  0.387911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2863  urea ABC transporter, permease protein UrtB  56.92 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4362  inner-membrane translocator  54.48 
 
 		 386 aa  359  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.084908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0129  inner-membrane translocator  52.7 
 
 		 386 aa  349  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2259  urea ABC transporter, permease protein UrtB  56.15 
 
 		 386 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  41.51 
 
 		 540 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 547 aa  245  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 526 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 527 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 524 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 524 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  38.42 
 
 		 548 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  40.52 
 
 		 538 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.43 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 302 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.75 
 
 		 558 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 542 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.22 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 526 aa  223  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  36.05 
 
 		 542 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.53 
 
 		 545 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.71 
 
 		 520 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.77 
 
 		 528 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.99 
 
 		 537 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.26 
 
 		 550 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 537 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.21 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 551 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 554 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 537 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.96 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 529 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.9 
 
 		 308 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.79 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 300 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 308 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.22 
 
 		 495 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.94 
 
 		 495 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.5 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.79 
 
 		 308 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.79 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.56 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.53 
 
 		 308 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.56 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  36.53 
 
 		 534 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.83 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  33.96 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.57 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.35 
 
 		 551 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  34.29 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.68 
 
 		 292 aa  186  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.69 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.6 
 
 		 561 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 305 aa  170  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.95 
 
 		 297 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 545 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.72 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0189  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 567 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3588  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 294 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.4 
 
 		 539 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.4 
 
 		 539 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.49 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.32 
 
 		 540 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.3 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.9 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2329  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21186  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2337  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240816  normal  0.250903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2290  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.7 
 
 		 543 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.7 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  39.2 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.7 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.7 
 
 		 539 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.88 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  39.7 
 
 		 540 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>