More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1047 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1047  putative urea ABC transporter  100 
 
 		 385 aa  747    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.697374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19181  putative urea ABC transporter  99.22 
 
 		 385 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08871  putative urea ABC transporter  78.96 
 
 		 384 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08851  putative urea ABC transporter  78.7 
 
 		 384 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.527406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0828  putative urea ABC transporter  78.44 
 
 		 384 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29731  putative urea ABC transporter  74.81 
 
 		 384 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2249  putative urea ABC transporter  73.51 
 
 		 384 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2619  putative urea ABC transporter  54.12 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.268669  normal  0.387911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2863  urea ABC transporter, permease protein UrtB  56.89 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4362  inner-membrane translocator  53.59 
 
 		 386 aa  357  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.084908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0129  inner-membrane translocator  53.45 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2259  urea ABC transporter, permease protein UrtB  56.38 
 
 		 386 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 540 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  40.05 
 
 		 547 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 548 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 527 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.8 
 
 		 545 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  40.36 
 
 		 538 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.91 
 
 		 297 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  36.05 
 
 		 542 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.22 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.53 
 
 		 545 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 524 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.77 
 
 		 528 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.26 
 
 		 550 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 524 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 551 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  39.1 
 
 		 534 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.69 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 554 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.96 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 529 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.63 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 542 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 526 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 542 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 553 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.83 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.34 
 
 		 537 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.22 
 
 		 495 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.94 
 
 		 495 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.5 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 537 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.83 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.83 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.29 
 
 		 308 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.83 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.56 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.57 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.29 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  34.79 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  33.96 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.37 
 
 		 551 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.69 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.47 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.68 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  33.68 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 301 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.13 
 
 		 297 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 524 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0189  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 567 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.62 
 
 		 304 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3588  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 294 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.3 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.4 
 
 		 539 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.4 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.9 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  41.33 
 
 		 520 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2329  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21186  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2337  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240816  normal  0.250903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2290  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.7 
 
 		 543 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  33.16 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.7 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2595  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  39.2 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.7 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.7 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.7 
 
 		 540 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>