More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2619 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2619  putative urea ABC transporter  100 
 
 		 386 aa  746    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.268669  normal  0.387911 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29731  putative urea ABC transporter  55.75 
 
 		 384 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2249  putative urea ABC transporter  55.47 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08871  putative urea ABC transporter  54.4 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19181  putative urea ABC transporter  54.64 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08851  putative urea ABC transporter  54.4 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.527406  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1047  putative urea ABC transporter  54.12 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.697374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0828  putative urea ABC transporter  53.89 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4362  inner-membrane translocator  53.98 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.084908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2863  urea ABC transporter, permease protein UrtB  55.53 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0129  inner-membrane translocator  53.06 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2259  urea ABC transporter, permease protein UrtB  54.34 
 
 		 386 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 547 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.5 
 
 		 545 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.23 
 
 		 558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 540 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  37.53 
 
 		 538 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.98 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.98 
 
 		 537 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 542 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 537 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 542 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.26 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  35.6 
 
 		 542 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  36.13 
 
 		 543 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.68 
 
 		 561 aa  186  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3588  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 304 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.25 
 
 		 304 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  33.24 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.16 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.71 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.24 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.65 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.51 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.29 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.64 
 
 		 525 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.45 
 
 		 308 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  40.4 
 
 		 534 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.91 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.71 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.31 
 
 		 528 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.21 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 524 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  41.62 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.62 
 
 		 293 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.94 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  38 
 
 		 526 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  40.1 
 
 		 545 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.3 
 
 		 543 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 548 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 527 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.1 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.11 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2252  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.1 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.11 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.1 
 
 		 549 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.3 
 
 		 545 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  39.6 
 
 		 540 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 		 538 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.6 
 
 		 552 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 537 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.41 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 542 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 542 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 542 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 540 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.38 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.81 
 
 		 550 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 542 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.12 
 
 		 540 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1710  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.56 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38 
 
 		 539 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 534 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  37.13 
 
 		 538 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.12 
 
 		 539 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 539 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 553 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.87 
 
 		 308 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.12 
 
 		 539 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.12 
 
 		 539 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5669  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.8 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 539 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3733  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 539 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4635  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 545 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  38 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0227  Fis family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 537 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.903114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>