More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0129 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0129  inner-membrane translocator  100 
 
 		 386 aa  749    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2863  urea ABC transporter, permease protein UrtB  69.15 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4362  inner-membrane translocator  66.75 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.084908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2259  urea ABC transporter, permease protein UrtB  64.16 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2249  putative urea ABC transporter  55.15 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29731  putative urea ABC transporter  54.9 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0828  putative urea ABC transporter  55.67 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08851  putative urea ABC transporter  56.3 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.527406  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08871  putative urea ABC transporter  56.3 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1047  putative urea ABC transporter  53.45 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.697374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19181  putative urea ABC transporter  52.7 
 
 		 385 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2619  putative urea ABC transporter  53.06 
 
 		 386 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.268669  normal  0.387911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  41.93 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.73 
 
 		 545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 526 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.38 
 
 		 545 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  41.6 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.36 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.5 
 
 		 539 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1102  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.07 
 
 		 561 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.28 
 
 		 529 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.16 
 
 		 539 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 500 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 529 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.36 
 
 		 525 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 524 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 547 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 526 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3113  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.1 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 545 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 529 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.22 
 
 		 543 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.56 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.94 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.29 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  35.93 
 
 		 538 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.25 
 
 		 543 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.33 
 
 		 533 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.67 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  39 
 
 		 533 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  39 
 
 		 515 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  40 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5580  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.67 
 
 		 529 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 551 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1710  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.96 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.33 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5669  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.24 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3733  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4635  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.27 
 
 		 308 aa  176  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.59 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.23 
 
 		 528 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1437  inner-membrane translocator  35.01 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 526 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.27 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.55 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.87 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3588  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 304 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.88 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.55 
 
 		 515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.59 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.73 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 294 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2329  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 294 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21186  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2337  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 294 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240816  normal  0.250903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2290  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 294 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  42.4 
 
 		 538 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.67 
 
 		 551 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  49.23 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  40.28 
 
 		 542 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  39.9 
 
 		 553 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 542 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 542 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.74 
 
 		 537 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.2 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2595  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 537 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.74 
 
 		 520 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 545 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 554 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2252  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.11 
 
 		 543 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  40.09 
 
 		 548 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.42 
 
 		 540 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>