More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
304 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.06 
 
 
308 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  58.75 
 
 
304 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  60.6 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.07 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  58.75 
 
 
304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  59.54 
 
 
304 aa  355  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  58.28 
 
 
304 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  57.28 
 
 
305 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  59.27 
 
 
303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  58.61 
 
 
314 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  56.58 
 
 
303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.82 
 
 
305 aa  332  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  59.6 
 
 
303 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.28 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  57.28 
 
 
550 aa  322  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  53.11 
 
 
351 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 
298 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.49 
 
 
304 aa  288  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.33 
 
 
308 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.82 
 
 
302 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.2 
 
 
315 aa  275  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  49.5 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  49.5 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  50 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
303 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
303 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 
293 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 
307 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.05 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
298 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.42 
 
 
279 aa  162  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
291 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
324 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
324 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
286 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
287 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
287 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
287 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
287 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
284 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
327 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  30.1 
 
 
334 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  28.9 
 
 
259 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.45 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.45 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.45 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  28.73 
 
 
272 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  30.14 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  33.18 
 
 
258 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  28.19 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.52 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  31.43 
 
 
267 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  25.82 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  25.82 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234758  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.7 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.84 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  30.14 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.78 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2380  gluconate 5-dehydrogenase  30.29 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667021  decreased coverage  0.0022048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  27.75 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  30.29 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  26.42 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  31.01 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.49 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.78 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.32 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.15 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.15 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.15 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.15 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.15 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0604  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.06 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000356681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>