More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0897 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  100 
 
 
304 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  92.11 
 
 
304 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  71.71 
 
 
304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  73.84 
 
 
308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  73.68 
 
 
314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.72 
 
 
308 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 
303 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  70.72 
 
 
303 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.44 
 
 
309 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  73.03 
 
 
303 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  67.21 
 
 
305 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  68.42 
 
 
304 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  68.75 
 
 
550 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.69 
 
 
304 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.82 
 
 
305 aa  363  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  61.79 
 
 
351 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  58.75 
 
 
304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  60.81 
 
 
307 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  60.81 
 
 
307 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  60.47 
 
 
307 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.78 
 
 
308 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  64.09 
 
 
298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.6 
 
 
304 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.55 
 
 
315 aa  315  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.3 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 
304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.72 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.52 
 
 
303 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.64 
 
 
302 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
298 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.34 
 
 
279 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
290 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
283 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
288 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
280 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
283 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
287 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
287 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
287 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
287 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
284 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
287 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
286 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
288 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  32.47 
 
 
334 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
324 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
286 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
322 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
327 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
270 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
270 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
270 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
268 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
250 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.47 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.982216  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4911  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.05 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.361501  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.17 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.09 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.65 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.52 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.74 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.05 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 
252 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.52 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28.52 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.89 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.03 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  27.24 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.03 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>