More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1508 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.78 
 
 
288 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.1 
 
 
287 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.44 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.15 
 
 
287 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.15 
 
 
287 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.15 
 
 
287 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.91 
 
 
270 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.91 
 
 
270 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.91 
 
 
270 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.87 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 
268 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
272 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
322 aa  199  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  41.28 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.74 
 
 
279 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 
304 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
304 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
305 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
304 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
304 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
298 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 
307 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 
307 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
307 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 
308 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
303 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
293 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
302 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.16 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
290 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
283 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.19 
 
 
304 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
303 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
283 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
303 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
305 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
284 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
291 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  32.36 
 
 
550 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
304 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 
244 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.63 
 
 
248 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.111569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
262 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.46 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  30.04 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
245 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.78 
 
 
245 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  32.71 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
253 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.17 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.23 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  28.29 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.05 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  32 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2084  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.4 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.8 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.11 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.56 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  30.65 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.19 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.08 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.06 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>