More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12303 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  100 
 
 
334 aa  692    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
324 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
324 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
327 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
322 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
287 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
287 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
287 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
286 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
287 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.54 
 
 
279 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
286 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
288 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
298 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
308 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
291 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
304 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
277 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 
303 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
304 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
307 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
304 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  33.44 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 
304 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
268 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 
308 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
302 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
272 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
303 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
293 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 
307 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 
307 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
308 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 
307 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.79 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  33.33 
 
 
550 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  33.11 
 
 
298 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.14 
 
 
283 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
283 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.48 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 
351 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.1 
 
 
304 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.88 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 
290 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
304 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
280 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
284 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
291 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 
252 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.78 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.94 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.12 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.78 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.78 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
272 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.12 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.11 
 
 
249 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  28.78 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.17 
 
 
248 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.44 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.2 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.56 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.8 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  28.41 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  28.41 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0830  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1052  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.67 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2263  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  29.73 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.88 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>