More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2412 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
303 aa  604  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.79 
 
 
303 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.31 
 
 
304 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  69.05 
 
 
298 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.41 
 
 
307 aa  363  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.82 
 
 
293 aa  353  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
304 aa  344  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  61.07 
 
 
304 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.12 
 
 
308 aa  328  9e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  59.36 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.32 
 
 
309 aa  322  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  61.07 
 
 
308 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 
305 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  56.52 
 
 
304 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  58.45 
 
 
304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  54.27 
 
 
304 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  58.51 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  57.89 
 
 
314 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  58.36 
 
 
303 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.99 
 
 
302 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.15 
 
 
315 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  58.51 
 
 
303 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.16 
 
 
304 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  58.3 
 
 
550 aa  289  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 
351 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
307 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  53.51 
 
 
307 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  53.51 
 
 
307 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  51 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 
308 aa  268  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.87 
 
 
279 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
283 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.66 
 
 
283 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
284 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
322 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.99 
 
 
324 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
280 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
327 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
291 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
287 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
287 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
287 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
288 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  32.89 
 
 
334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.31 
 
 
287 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
277 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.36 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  28.84 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  29.6 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  30.8 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
259 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  35.16 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  32.16 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.85 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.78 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.21 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  27.92 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  29 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  28.86 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  27.44 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000369604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.85 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  30.19 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
258 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.85 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
249 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>