More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2684 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
307 aa  633    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.17 
 
 
304 aa  529  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.58 
 
 
293 aa  360  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.82 
 
 
303 aa  348  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.41 
 
 
303 aa  345  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  61.41 
 
 
298 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.53 
 
 
304 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  55.52 
 
 
308 aa  314  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.64 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  51.64 
 
 
304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.36 
 
 
302 aa  305  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  52.65 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  52.98 
 
 
303 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  51.16 
 
 
305 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  52.46 
 
 
304 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.5 
 
 
305 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  52.32 
 
 
314 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  50.68 
 
 
315 aa  292  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.88 
 
 
309 aa  292  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  50.49 
 
 
303 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  51.99 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.74 
 
 
304 aa  279  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  52.05 
 
 
550 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  49.35 
 
 
307 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  49.52 
 
 
351 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.44 
 
 
304 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.5 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
308 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.05 
 
 
279 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
324 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
324 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
290 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
287 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
283 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
283 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
322 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
286 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
291 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  33.87 
 
 
334 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
280 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
286 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
288 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 
277 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
291 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
270 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
270 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
270 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
272 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
256 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
295 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.55 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.55 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.22 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.09 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.09 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.11 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.51 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.22 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
285 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  29.86 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3164  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  32.31 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457753  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.06 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.72 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.17 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2551  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  32.31 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  26.88 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>