More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6842 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  36.89 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  36.89 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.2 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  35.92 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 249 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.77 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0671511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.73 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6803  hypothetical protein  35.44 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  30.12 
 
 		 257 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 262 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  31.37 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  30.62 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.95 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>