More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3798 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.19 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.36 
 
 		 246 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.19 
 
 		 246 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.96 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 293 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  42.79 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  42.79 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  42.79 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 274 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 289 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  41.03 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.25 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.89 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  43.68 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 247 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 285 aa  118  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.77 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  39.91 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.5 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  39.2 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>