More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3931 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  79.2 
 
 		 278 aa  431  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.01 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.06 
 
 		 279 aa  333  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  59.64 
 
 		 272 aa  332  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  61.45 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  61.96 
 
 		 277 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  59.06 
 
 		 298 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  62.18 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  62.18 
 
 		 273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  60.87 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  59.27 
 
 		 271 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  60.51 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  59.78 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.48 
 
 		 284 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.61 
 
 		 289 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  61.37 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.4 
 
 		 284 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  59.42 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  57.25 
 
 		 284 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.04 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.88 
 
 		 289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  56.88 
 
 		 284 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  56.88 
 
 		 284 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.71 
 
 		 280 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  55.04 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.48 
 
 		 275 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  55.76 
 
 		 281 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  51.61 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  54.1 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  53.6 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  53.6 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  55.43 
 
 		 274 aa  282  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.96 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  52.52 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.96 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  52.16 
 
 		 274 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  48.93 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 		 296 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  48.91 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  48.91 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  48.91 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  47.46 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  40.45 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.06 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.49 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  31.56 
 
 		 255 aa  95.9  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.29 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.52 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3017  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.49 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.84 
 
 		 259 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 255 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.65 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  28.4 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.15 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.5 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>