More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2808 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  100 
 
 
274 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  62.13 
 
 
274 aa  362  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  63.6 
 
 
274 aa  355  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  63.24 
 
 
274 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  62.87 
 
 
274 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.56 
 
 
279 aa  315  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  57.09 
 
 
273 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.87 
 
 
272 aa  301  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.21 
 
 
275 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 
284 aa  295  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 
293 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  54.81 
 
 
269 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  54.81 
 
 
269 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  54.74 
 
 
273 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.77 
 
 
289 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  54.38 
 
 
273 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  54.74 
 
 
273 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.14 
 
 
284 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 
293 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  52.19 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 
284 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  50.73 
 
 
271 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  51.09 
 
 
280 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  53.14 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 
285 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 
285 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 
285 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  49.09 
 
 
289 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.65 
 
 
284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  49.08 
 
 
286 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  51.09 
 
 
272 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  49.64 
 
 
274 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 
275 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  47.89 
 
 
282 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 
284 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 
284 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 
284 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 
284 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  47.13 
 
 
281 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
277 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  47.46 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 
281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  47.12 
 
 
278 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
287 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
283 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
292 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  37.74 
 
 
263 aa  170  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
246 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
246 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
246 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
246 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
260 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
246 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
249 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
293 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.74 
 
 
249 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.68 
 
 
260 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.68 
 
 
260 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.78 
 
 
236 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
253 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
245 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
287 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 
249 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 
254 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
248 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
249 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
335 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
249 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
335 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
249 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
257 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
261 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.69 
 
 
247 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
258 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
246 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
335 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
280 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
240 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
261 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
248 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.45 
 
 
238 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
248 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 
247 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  28.57 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
309 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.27 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
249 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>