More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13251 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 282 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  87.1 
 
 		 281 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  83.39 
 
 		 284 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  84.59 
 
 		 281 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  83.03 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  83.03 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  83.51 
 
 		 284 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.22 
 
 		 284 aa  394  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.8 
 
 		 289 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.99 
 
 		 284 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.57 
 
 		 280 aa  331  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  58.93 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.51 
 
 		 289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 		 284 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.82 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.46 
 
 		 272 aa  324  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  58.3 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  57.5 
 
 		 293 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  56.43 
 
 		 293 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  56.79 
 
 		 291 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.73 
 
 		 275 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  55.88 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  56.99 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  57.2 
 
 		 273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  57.2 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  56.83 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  58.46 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  53.16 
 
 		 269 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  52.79 
 
 		 269 aa  289  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  54.41 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  54.68 
 
 		 278 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  54.1 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  54.02 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  49.64 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  49.64 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  52.67 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  49.27 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  50.78 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  47.89 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 292 aa  171  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  35.45 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.68 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.5 
 
 		 240 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.12 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 250 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 		 238 aa  92.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  32.42 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.55 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4227  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4155  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>