More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3295 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.67 
 
 		 272 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.77 
 
 		 275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  64.21 
 
 		 277 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.81 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  61.17 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.15 
 
 		 284 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  61.03 
 
 		 273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  60.81 
 
 		 293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  60.66 
 
 		 273 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  60.66 
 
 		 273 aa  324  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  60.44 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.78 
 
 		 289 aa  323  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  59.64 
 
 		 275 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  58.61 
 
 		 293 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  58.24 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.04 
 
 		 284 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.41 
 
 		 284 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.93 
 
 		 289 aa  314  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  61.09 
 
 		 278 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  59.78 
 
 		 285 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  52.61 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  52.61 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  56.25 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.04 
 
 		 290 aa  295  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.91 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.62 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  52.03 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  52.03 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  51.09 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 285 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 285 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 285 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  51.26 
 
 		 295 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  52.16 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 		 284 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  51.1 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  48.53 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  47.78 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.69 
 
 		 287 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 292 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  38.2 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.96 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  34.33 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.98 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.96 
 
 		 248 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.37 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.53 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.46 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.41 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>