More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3600 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 287 aa  563  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.86 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 249 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  34.46 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  34.46 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.59 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  35.98 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  34.07 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.07 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  31.46 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  31.46 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.19 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1993  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.67 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  39.52 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.19 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.74 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>