More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1490 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
309 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.18 
 
 
295 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.62 
 
 
295 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.27 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.27 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.18 
 
 
295 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.81 
 
 
299 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
287 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 
262 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 
262 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 
262 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4264  hypothetical protein  67.18 
 
 
151 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
271 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.92 
 
 
280 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
255 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
252 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
288 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
255 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.54 
 
 
236 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  42.21 
 
 
255 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
274 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
257 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
248 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  38.84 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
252 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
246 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
247 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3848  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
256 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.29 
 
 
247 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
257 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
308 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
274 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
261 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
254 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
246 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
266 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
256 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
246 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
254 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
246 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
255 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.12 
 
 
251 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
256 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
253 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
231 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  41.03 
 
 
252 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
249 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
248 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
287 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
252 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
231 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
263 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 
255 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
249 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.68 
 
 
247 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
253 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
247 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.86 
 
 
247 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
273 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.87 
 
 
249 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
249 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.61 
 
 
247 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
259 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
284 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
265 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
288 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
284 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
284 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.42 
 
 
249 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
246 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40 
 
 
246 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  38.38 
 
 
250 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  41.35 
 
 
261 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
255 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
261 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.61 
 
 
246 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521218  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2694  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier- protein) reductase  39.57 
 
 
248 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
246 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
238 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
246 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
246 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 
282 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 
254 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
246 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
246 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
246 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>