54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4264 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4264  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  306  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306344  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.71 
 
 		 309 aa  181  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.14 
 
 		 295 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 		 295 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 		 295 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 		 295 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 295 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.48 
 
 		 299 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 262 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 262 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 262 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.98 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.89 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 		 226 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 234 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 234 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 283 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.11 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 233 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.89 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0228145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  36.84 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 246 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  46 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1543  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174078  normal  0.0303044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0712  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60 
 
 		 246 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000308432  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 		 247 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 251 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 261 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.81 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 308 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 253 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 260 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 254 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 253 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 253 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  54.29 
 
 		 249 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.08 
 
 		 264 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>