More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1902 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.85 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 		 309 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 295 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.88 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.21 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.5 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.6 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  39.32 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0969  putative short-chain alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00190431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.93 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.88 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  39.42 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.75 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.92 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.92 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.83 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.5 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.55 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  39.39 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.76 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.18 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.96 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.86 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  34 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>